Common Genetics

Data Sources: 
Moreau et al. Haematologica 2011; 96(4):574-582
Chesi et al. Blood 2001; 97(3):729-736
Keats et al. Cancer Cell 2007; 12(2):131-144
Garnett et al. Nature 2012; 483(7391):570-575 (PMID:)
Barretina et al. Nature 2012; 483(7391):603-607

HD - Homozygous Deletion
(cc) - Confirmed and/or Observed in the Cell line Characterization Project
(CCLE) - Broad Institute Cancer Cell Line Encyclopedia

Showing 92 items
Cell LineIgH TxBIRC2/3BRAFCDKN2CFGFR3KRASNRASRB1TP53TRAF3
Sort 
 
Sort 
 
Sort 
 
Sort 
 
Sort 
 
Sort 
 
Sort 
 
Sort 
 
Sort 
 
Sort 
 
Sort 
 
Cell LineIgH TxBIRC2/3BRAFCDKN2CFGFR3KRASNRASRB1TP53TRAF3
           
ALMC-2 t(14;20)          
ARP1 t(14:16)   HD     HD  
CAG t(14;16)   HD     HD  
BCN t(14;16)     Wt Wt  Wt  
MDN t(11:14)     Wt G13D  Wt  
NAN1 t(14;16)     Wt Wt  E180X  
NAN6 t(14;20)     Wt Wt  HD  
SBN      Wt Wt  Wt  
XG-3      Wt Q61L  Wt  
XG-5 t(11:14)     Wt Wt  R282W  
XG-11 t(11:14)     Wt Wt  C135Y  
XG-12 t(14;16)     Wt Q61L  Wt  
XG-13 t(14;16)     Wt Wt  R248Q  
XG-16      Wt Q61H  Y220C  
XG-19 t(14;16)     Wt Wt  Wt  
XG-20 t(4;14)     Wt Wt  HD  
XG-21 t(11;14)     Wt Wt  Wt  
XG-14 t(11;14)     Wt Q61L - Het  G266E  
XG-4      Wt Wt  R181C - Het  
MM.1.144 t(14;16)   HD  G12A    K536-N545delinsD - Homo 
NAN3 t(4;14)     Wt Q61H  R248Q - Het  
XG-24 t(4;14)     G12V - Het Wt  Wt  
XG-10      S13C - Het Wt  Wt  
Delta47      Wt Wt   Wt 
SACHI t(14;20)         Wt 
KAS-6/2           
KMS-24           
KPMM-2           
KMS21-BM       Q61L - het (cc)    
Karpas 417       Q61K - het (cc)    
L363 t(20;22)     Wt Q61H - Het (cc)  S261T - Homo Wt 
NCI-H929 t(4;14)    Expressed Wt G13D - het (cc)  Wt Wt 
KHM-1B    HD  G12C - het (cc)   HD Wt 
KMS-28BM t(4;14)    Expressed G12A - homo (cc)    Wt 
MM.1S t(14:16)   HD  G12A - het (cc) Wt  Wt K536-N545delinsD - Homo (cc) 
MM.1R t(14;16)   HD  G12A - het (cc)    K536-N545delinsD - Homo (cc) 
PCM-6         R248Q (CCLE)  
Karpas 929       G13D - het (cc)    
KHM-11 t(4;14)    Expressed Wt Q61K - het (cc)   Wt 
OCI-MY7 t(11;14)   HD   Q61K - het (cc)   Wt 
OH2       Q61K -homo (cc)    
AMO-1 t(12;14)     A146T - het (cc) Wt  Wt A484Afs - het (cc) 
JMW-1 t(4;14)     G12V - het (cc)     
KP-6    HD  G12D - homo (cc)     
MOLP-8 t(11;14)     delK179 - het (cc) Q61L - het (cc)    
XG-6 t(16;22)   HD  Q61E - het & L19F - het (cc) Wt  Wt Wt 
U-266 t(11;14)***  K601N - Het (cc)   Wt Wt E419X - Homo & K228R - Homo (cc) A161T - Homo (cc) K550IfsX3 - Homo (cc) 
KMS-18 t(4;14) HD   G382D - het (cc) Expressed     Wt 
KMS-11 t(4;14) + t(14;16)    Y373C - Het (cc) Expressed Wt Wt  HD HD -> K191LfsX3 
XG-7 t(4;14)    T121A - homo (cc) Not Expressed G12C - het & Y64N - het (cc) Wt L470P - Homo (cc) Wt Wt 
Karpas 25  BIRC3 - E332X - het (cc)         
MM-M1       G12D - het (cc -see note)   Wt 
ARD t(14;16)   HD     HD  
JJN-3 t(14;16)     Wt See Note  HD (?) Wt 
ALMC-1 t(14;20)        M133K - homo (cc)  
ANBL-6 t(14;16)     Wt Wt  Q331X - homo (cc) Y425TfsX36 - Homo 
COLO-677      G12A - het (cc)   E285K - homo (cc)  
DP-6   V600E - Het (cc) HD     FS - het + Y107X - het (cc)  
EJM t(14;20)     See Note Wt  K132N - homo (CCLE) (cc) Wt 
FLAM-76 t(11;14)     Wt Wt  S240R - het (cc) Wt 
FR4      A146T - het (cc) Wt  R175R - homo (cc) Wt 
H1112 t(11;14)     A146V - het (cc) Wt  R248W - het (cc) Wt 
INA-6 t(11;14)      G12D - het (cc -see note)  Q331X - het + K132M - het (cc) Wt 
JIM-1 t(4;14)        R273C - homo (cc)  
JIM-3 t(4;14)    Not Expressed G12D - het (cc) Wt  R273C - homo (cc) Wt 
JK-6L      Q61L - het (cc) Y64D - homo (cc)*  Splice-Site - het (cc) Wt 
Karpas 620 t(11:14)   HD  G12D - het (cc) Wt  C135Y - homo (CCLE)(cc) Wt 
KAS-6/1 t(4;14)    Expressed    R273C - homo (cc)  
KMM-1 t(6;14)     Wt G13D - homo (cc)  S241F - het (CCLE)(cc) Wt 
KMS-12BM t(11;14)    R158W - het Wt Wt  R337L - homo (cc) Wt 
KMS-12PE t(11;14)   HD S321C - het (cc) Wt Wt  R337L - Homo (cc) Wt 
KMS-20  HD  HD  G12S - homo (cc)   Y126X - homo (CCLE)(cc) Wt 
KMS-26    HD Expressed    R175H - homo (CCLE)(cc) Wt 
KMS-27       Q61R - het (cc)  Splice-site + Splice-site (cc)  
KMS-28PE t(4;14) HD   Expressed G12A - homo (cc)   G105R - homo (cc) Wt 
KMS-34 t(4;14)    Expressed    W146X - homo (CCLE)(cc) S352N - het (cc) [see note] 
LP-1 t(4;14)    F384L (1000G SNP) Wt Wt  E286K - Homo (cc) K286IfsX7 - Homo (cc) 
MOLP-2  BIRC3 - V120G - het (cc)  HD     A159V - homo (CCLE)(cc)  
OCI-MY1    HD  G13D - het (cc)   R280G - homo (cc) HD 
OCI-MY5 t(14;16)   HD  Wt Wt  FS - homo (cc) Wt 
OPM-1 t(4;14)   HD K650E - Het Q71X   R175H - homo (cc) Wt 
OPM-2 t(4:14)   HD K650E - Het Wt Wt  R175H - homo (CCLE)(cc) Wt 
PE1 t(11;14)     Wt Wt  R280S - homo (cc) Wt 
PE2 t(4;14)    Not Expressed  Q61K - het (cc)  G244V - homo (cc) Wt 
RPMI-8226 t(14;16)   HD  G12A - Het (cc) Wt  E285K - Homo (cc) HD -> K191LfsX60 
SKMM-1 t(14;20) BIRC2 - C109F - homo (cc)    Wt G12D - het (cc -see note)  R175G - het (cc) Wt 
SKMM-2 t(11;14)   HD  Wt Wt  K132N - Homo (cc) Wt 
UTMC-2 t(4;14)    Expressed Wt Wt L185X - Homo (cc) W246X - homo (cc) HD (?) Wt 
VP-6         A161D - homo (cc)  
XG-1 t(11;14)     Wt G12R - het (cc)  Y126N - homo (cc) Wt 
XG-2 t(12:14)     G12A - het (cc) Wt  R213X - het + C176Y - het (cc) Wt 
Showing 92 items
Comments